среда, 19 апреля 2023 г.

среда, 29 июня 2022 г.

timelane using ggplot2

 matplotlib

https://devpractice.ru/matplotlib-lesson-1-quick-start-guide/

_____________________________________________

 Смотрела стили графиков тут https://www.data-to-viz.com/caveats.html


событие - это точка начала, точка конца, они соединены горизонтальной линией, линии разнесены по горизонтали (order by date_start)


Точки, соединенные линиями https://r-graph-gallery.com/connected_scatterplot_ggplot2.html


Библиотека для работы со временем  https://r-graph-gallery.com/191-manage-date-data.html


График можно сделать интерактивным  https://r-graph-gallery.com/163-interactive-area-chart-plotly.html


__________________

Здравствуйте, Дмитрий. По поводу того как можно отображать события в виде горизонтальных линий (где по оси х - время).

Входные данные - это время начала и конца события и его название. Можно все сделать "в лоб": написать функцию, которая, предобработав входные данные, будет рисовать эти горизонтальные линии (geom_point, geom_segment), разнося их по вертикали.

А нет ли для этого уже готовых решений? Не буду ли я тут "изобретать велосипед"?

__________________

https://timeline.knightlab.com/#overview



вторник, 15 июня 2021 г.

Rewriting the recursive algorithm iteratively in python

Либо 

import sys 

sys.setrecursionlimit(1500) 


Либо

Any recursive function can be made to iterate (into a loop) but you need to use a stack yourself to keep the state.

Normally, tail recursion is easy to convert into a loop:

A(x) {
  if x<0 return 0;
  return something(x) + A(x-1)
}

Can be translated into:

A(x) {
  temp = 0;
  for i in 0..x {
    temp = temp + something(i);
  }
  return temp;
}

Other kinds of recursion that can be translated into tail recursion are also easy to change. The other require more work.

The following:

treeSum(tree) {
  if tree=nil then 0
  else tree.value + treeSum(tree.left) + treeSum(tree.right);
}

Is not that easy to translate. You can remove one piece of the recursion, but the other one is not possible without a structure to hold the state.

treeSum(tree) {
  walk = tree;
  temp = 0;
  while walk != nil {
    temp = temp + walk.value + treeSum(walk.right);
    walk = walk.left;
  }
}

понедельник, 14 июня 2021 г.

Human Phenotype Ontology

  https://github.com/davetang/human_phenotype_ontology/blob/master/README.md


https://www.taylorfrancis.com/books/mono/10.1201/b10967/introduction-bio-ontologies-peter-robinson-sebastian-bauer

четверг, 31 октября 2019 г.

EDA


EDA

Программирование

pandas DataFrame

sparse matrices

Теория


1) Обзор методов классификации по содержанию этой книжки.
2) Практика Linear classification - смотри topic4 тут.
3) Подробнее про linear и logistic regression тут.
4) Bagging, Random Forest, Feature Importance, Gradient boosting - 3 неделя mlcourse.

Какие бывают распределения, давно хочу расписать, скажем, в виде плаката: тут и тут

пятница, 8 марта 2019 г.

binary classification test

В куче всех этих похожих аббривиатур хорошо помогает разобраться эта вики-статья (см. формулы из confusion matrix).